E.coliDH10B碱性磷酸酶基因的克隆、表达及活性研究-医学论文
E.coliAKP催化机制明确,底物范围广泛,作为工具酶在表位连锁、组织化学、免疫印迹、突变分析等方面有广泛应用。E.coliDH10B无致病性和耐药基因,是基因克隆的常用受体菌。本研究首次从E.coliDH10B基因组中克隆了AKP的成熟肽基因(phoAm)并进行了表达研究,从而为此种酶的结构、功能和应用研究打下了坚实的基础。
1材料与方法
1.1材料
1.1.1菌株、载体大肠杆菌菌株E.coliDH10B、E.coliBL21(DE3)、E.coliDH5α及原核表达载体pET28a(+)由热带生物资源教育部重点实验室保存。
1.1.2试剂T4DNA连接酶、限制性核酸内切酶BamHⅠ、HindⅢ、氨苄青霉素、卡那霉素、异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)、对硝基苯磷酸(pNPP)购自生工生物(上海)有限公司。质粒提取试剂盒、DNA产物纯化试剂盒、PfuDNA聚合酶购自天根生化科技(北京)有限公司。His标签蛋白纯化试剂盒、重组标签蛋白快速检测试剂盒GoldCassette-HIS购自北京康为世纪生物科技有限公司。
1.1.3引物引物设计后由生工生物(上海)有限公司合成。
1.1.4仪器UV-2450紫外可见分光光度计(岛津);超微量黑色石英比色皿(岛津);PCR扩增仪(2720ThermalCyclerAppliedBiosystems);凝胶成像系统(BioRad)。
1.2方法
1.2.1E.coliDH10B基因组DNA的提取与纯化E.coliDH10B甘油菌经LB培养液增菌培养后,用天根公司的细菌基因组DNA提取试剂盒进行提取与纯化。提取的基因组DNA用紫外分光光度法进行评价。
1.2.2引物设计从Genbank数据库下载E.coliDH10B的phoA基因序列(accessionnumber:NC-010473),使用PrimerPremier6.0和Oligo7.37辅助设计用于扩增AKPphoAm的引物,为便于克隆进表达载体pET28a中,在引物两端加上适当的酶切位点和保护碱基。设计的引物如下,正向引物(phoAm-F):5'-GTCATGGATCCCGGACACCAGAAATGCC-3'(BamHⅠ);反向引物(phoAm-R):5'-GCGACAAGCTTTATTTCAGCCCCAGAGC-3'(HindⅢ)。
1.2.3PCR法扩增phoA基因在0.2mlPCR管内配制50μl反应体系,按下述程序进行PCR扩增:94℃预变性3min;扩增30个循环,即94℃30s→55℃30s→72℃2min;72℃延伸5min。反应结束后,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测并进行测序。
1.2.4phoAm基因的克隆PCR产物经DNA产物纯化试剂盒纯化后,用限制性内切酶BamHⅠ和HindⅢ双酶切,并与同样经BamHⅠ和HindⅢ双酶切的表达载体pET28a(+)经T4DNA连接酶连接后,转化E.coliBL21(DE3)感受态细胞,经LB/kan筛选平板培养后,用菌落PCR鉴定转化子。
1.2.5phoAm基因的诱导表达分别接种pET28a-phoAm/BL21(DE3)和pET28a/BL21(DE3)单菌落至5mlLB培养液中,37℃振荡培养过夜。按1%的比例接种阳性菌液至100mlLB培养液中,37℃振荡培养,至菌液OD600nm约为0.4时,加入终浓度为1mmol/L的IPTG进行诱导,继续培养3h。
1.2.6重组蛋白(rAKP)的检测菌体离心后,加入缓冲液超声破碎,离心取上清液,用免疫金层析法检测6×His标签,用SDS-PAGE法检测表达蛋白。
1.2.7重组蛋白(rAKP)的纯化采用Ni-AgaroseHis标签蛋白纯化试剂盒进行纯化。对洗脱液进行SDS-PAGE分析并用Bradford法定量。
1.2.8重组蛋白(rAKP)的活性分析采用对硝基酚磷酸(pNPP)法测定rAKP的活性。取发酵菌体超声破碎后的上清液,加入测活液,30℃反应10min,加入终止液终止反应,于波长410nm处测吸收值。
2结果
2.1PCR扩增E.coliDH10B成熟肽基因(phoA)
PCR产物在琼脂糖凝胶电泳上分析,可见1.4kb的条带(图1)大小与预期一致。
1.DNAMarker;2.PCR产物
图1E.coliDH10BphoAmPCR产物的琼脂糖凝胶电泳
2.2重组蛋白(rAKP)的表达与检测
重组菌诱导表达后,取超声破碎后的上清液,分别用免疫金层析法快速检测6×His标签(图2),用SDS-PAGE法检测表达蛋白(图3)。rAKP的分子量约为47K。
1:阴性对照;2:rAKP(含6×His标签)
图2免疫金层析法快速检测His标签蛋白
从左至右分别为诱导0、2、4h;第4泳道为蛋白质分子量Marker
图3SDS-PAGE检测诱导表达的rAKP
2.3重组蛋白(rAKP)的活性分析
rAKP经活性分析,对照菌E.coliBL21(DE3)的OD405nm为0.120,重组菌E.coliBL21(DE3)/phoAm的OD405nm为2.58,即重组菌的碱性磷酸酶活性提高21.5倍。
3讨论
本研究首次从E.coliDH10B菌株的基因组中克隆了碱性磷酸酶成熟肽基因,并进行了表达、纯化与活性研究。E.coliAKP作为工具酶在表位连锁、组织化学、免疫印迹、突变分析等方面有广泛应用。目前市场上常见的AKP产品有虾碱性磷酸酶(SAP)和牛小肠碱性磷酸酶(CIAP),其中CIAP的活性最高,约为天然E.coliAKP的40倍[3]。与天然提纯的SAP和CIAP相比,E.coliAKP的生产成本低,热稳定性好。由于AKP的构效关系明确,且在定点诱变和结构改造方面积累了一定的经验[4-5]。进一步研究可结合计算机模拟对E.coliAKP的三维结构与催化活性之间的关系进行深入分析[6],利用当前蛋白质工程的先进技术手段对重组E.coliAKP进一步改构。
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