蛋白组学在心血管方面的研究进展解福生-医学论文
蛋白组学在利用干细胞修复心脏的概念具有巨大的潜力,但在临床实验之前,必须不确定性的治疗应用处理。蛋白质组技术可以帮助当代表征细胞准备更充分,找出潜在的原因,可能导致临床试验失败率较高一些。我们讨论了更广泛的应用蛋白质组学干细胞提供蛋白质的主要技术,并说明他们可能帮助干细胞疗法翻译细胞研究。关于内皮祖细胞(朋)的争议,其为标志物的分配和细胞纯度评估警示标志。内皮祖细胞中早期生长蛋白质组学领导方法已经提出了该标记用于确定其潜在的可能引起内皮细胞的蛋白质摄取血小板的认识。血小板微粒有关的特性转移到单核内皮细胞可以导致该法的误解。同样,血小板和血小板微粒的存在是没有考虑到当功能上的改进是直接归因于内皮祖细胞,而盐溶液或纯介质作为对照组。因此,蛋白质组学阐明一个共同的干细胞在心血管研究分析,这或许可以解释在一些领域的矛盾的新警告灯。
1蛋白质组学在各种蛋白修饰和标记中的应用
氨基酸标记策略在蛋白质组学技术中非常普遍@。由于质谱是作为蛋白质科学检测技术(临)的关键技术,所以对氨基酸进行标记显得非常重要。
系统研究往往是旨在发现的基本原则,支配或疾病背后的分子途径。为了达到这个目的我们需要不断进行技术开发。在此背景下,技术是指技能、伩器伩表和用来解决问题的方法乂策略。因此,每一个技术必须有某种特定的用途和使用。蛋白质组学是一个被驱动的发展和技术的战略性应用,它会继续快速的发展。
蛋白质组学技术被用于研究的复杂性和他们的生物作用的蛋白质,包括生物物理性质、结构和功能。它是基于一个前提,那就是他们的多样性,包括蛋白质的种类、单点核苷酸多型性、翻译后修饰等有关生物学范畴的知识。对于大部份的蛋白质来说,翻译后修饰是蛋白质生物合成的较后步骤。蛋白质,或是多肽,是一条胺基酸的链。当合成蛋白质时,20种不同的胺基酸会合并成为蛋白质。胺基酸的翻译后修饰会附在蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、不同的脂类及碳水化合物)改变胺基酸的化学性质,或是造成结构的改变(如建立双硫键),来扩阔蛋白质的功能。再者,酶可以从蛋白质的〜末端移除氨基酸,或从中间将肽链剪开。举例来说,胰岛素是肽的激素,它会在建立双硫键后被剪开两次,并在链的中间移走多肽前体,而形成的蛋白质包含了两条以双硫键连接的多肽链。其他修饰,就像磷酸化是控制蛋白质活动机制的一部份。蛋白质活动可以是令酶活性化或钝化。蛋白质发生变化,是因为生理和病理过程的反射在基因,哪八,旧哪八和代谢水平的变化。因此,由信息从蛋白质组蛋白的表达,磷酸化、加工、定位。改变翻译后修饰的化学本质的一种氨基酸的变化,能够引发残留在蛋白质结构、活力、结合伙伴或亚细胞定位。翻译后修饰可以添加或删除特定的氨基酸残基,翻译后修饰包括以下加入官能团的反应:乙酰化一通常于蛋白质的^末端加入乙酰。烷基化一加入如甲基或乙基等烷基。甲基化一烷基化中常见的一种,在赖氨酸、精氨酸等的侧链氨基上加入甲基。生物素化一用生物素附加物令保存的赖氨酸酰化。谷氨酸化一在谷氨酸与导管素及其他蛋白质之间建立共价键。甘氨酸化一在一个至超过40种甘氨酸与导管素的0末端建立共价键。糖化一将糖基加入天冬酰胺、羟离氨酸、丝氨酸或苏氨酸,形成糖蛋白。异戊二烯化一加入如法呢醇及四异戊二烯等异戊二烯。硫辛酸化一一附着硫辛酸的功能性。磷酸泛酰巯基乙胺基化―像在脂肪酸、聚酮、非核糖体肽链及白氨酸的生物合成中,从乙酰辅酶八加入4’磷酸泛酰巯基乙胺基。磷酸化一加入磷酸根至丝氨酸、酪氨酸、苏氨酸或组氨酸。硫酸化一将硫酸根加入至酪氨酸。硒化0末端酰胺化。蛋曰质组学领域正在努力的研究和量化蛋白质的多样性。它代表了一大类所产生的技术和方法分析,比如:蛋白质生物化学、解析分离、质谱和生物信息学。许多技术是相辅相成的作用^提供不同的数据为每个蛋白质组。蛋白质组学技术的发展也可以被应用到特定的生物学和临床问题上,这是互相起作用的过程,因为应用不同的技术可以提供额外的视角和产生新的假设,有时能够协助方法论的提炼和优化甚至产生大量的新技木。
技术的发展是--个涉及多个步骤的过程,这些步骤是:①开发阶段,新的方法或技术在尝试和错误中产生;②样机制作,其一致性和变异性是确定的;③早期大规模生产,其方法只需要很少的变化,是在多个不同的环境和条件下测试,并在条件允许的情况下进行微调;④正常生产和标准化,技术已经非常成熟并极少有问题产生;⑤建立方法,在更广泛的科学界建立强大的技术;⑥技术过时,此方法已经不被需要或者被更好的技术所取代。和许多其他的组织相比,蛋白质组学分析的心肌细胞和组织是一项特别的挑战,造成这种现象的原因是多因素的。比如:没有划分为心室心肌细胞的细胞培养系统。蛋白组学的主要技术
为了利用蛋白质组数据,我们必须找到办法来整合数据和模型的发展,了解细胞和器官的复杂性㈤。此外,我们需要更好的方法来改变蛋白质之间的联系和直接的功能和环境的健康和疾病细胞定位。令人兴奋的是,技术不是静止的,它将继续对旧技术进行改进和开发改造新的方法。蛋白质组学在心血管领域的研究正在迅速演变,更多新的发现货出现,科学界也会更多的采用蛋白质组学方法。
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